新疆医科大学位于新疆维吾尔自治区首府乌鲁木齐市，座落在风景秀丽的鲤鱼山脚下，1998年4月，经国家教育部批准由原新疆医学院和原新疆中医学院合并成立，同年9月10日正式挂牌成立新疆医科大学，时任国家主席江泽民亲自为新疆医科大学题写了校名。原新疆中医学院的前身是由前苏联在伊犁援助自1946年开始的卫生专科班，1950年迁至原新疆省二医院（现自治区人民医院内）并更名为乌鲁木齐卫生学校，1961年改称为新疆中医学校，1986年11月成立新疆中医学院。原新疆医学院始建于1954年，1956年建成开院，为前苏联援助下中国第一个五年计划156个重点项目之一，1978年世界卫生组织（WHO）正式认可的国际医学教育机构。
新疆医科大学自1998年挂牌成立以来，在办学规模、办学层次、办学水平等各方面有了长足的发展。现全校占地面积164.85万余m2（2473亩，含鲤鱼山公园1320亩），建筑面积61.59万m2（含四所附属医院），教学、医疗、科研设备总价值10.2亿元（含四所附属医院）；校图书馆拥有馆舍5452m2，藏书40.8万册；学校教职工5432人（含四所附属医院，其中民族1565人，占28.81%），其中专业技术人员4404人（其中民族1368人，占31.06%），本科以上学历专业技术人员1935人，占专业技术人员总人数的43.93%：硕士以上层次的专业技术人员349人，占本科以上学历人员总人数的18.03%；专职教师442人（其中民族158人，教授48人，副教授106人），具有高级专业技术职务人员784人，占本科以上学历人员总人数的40.7%；现有博士生导师27名，硕士生导师259名。全校有41名专家享受国家政府特殊津贴，16位同志被授予自治区有突出贡献的优秀专家称号。现有各类在校生15192名（其中民族6078名），其中博士、硕士研究生802名（其中民族194名，七年制研究生教育专业学生222名）；普通本、专科生6735名（其中民族3756名）；成人本、专科生6009名（其中民族1186名）；中专生1559名（其中民族942名）；外国留学生87人。
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